Si el grado de prolapso es muy importante, puede haber un soplo cardiaco, causado por movimiento anormal de las valvas grandes o por la fuga de sangre que existe a nivel de la válvula mitral (insuficiencia o regurgitación mitral).

La insuficiencia mitral es insignificante a menos de que llegue a un grado moderado o severo. Esto puede causar un engrosamiento de la pared del ventrículo izquierdo, ya que esta cámara tiene que bombear vigorosamente para compensar el flujo retrógrado de sangre a través de la válvula mitral.  La mayoría de los pacientes con prolapso de la válvula mitral tienen una insuficiencia mitral leve.

Aunque el prolapso de la válvula mitral no es usualmente serio, puede asociarse a síntomas menores como falta de aire, cansancio, palpitaciones cardiacas, dolor torácico, mareos, dolor de cabeza, e insomnio. Esta anomalía aumenta el riesgo de endocarditis infecciosa (inflamación del recubrimiento interno y/o de las válvulas cardiacas).